Para la operación de vaciado del separador de agua, ya sea para uso convencional o para uso en semirremolque, los pasos básicos son similares. Primero, busque el separador de agua en el vehículo, que generalmente se encuentra cerca del tanque de combustible y es cilíndrico. Debajo del filtro grueso en la parte inferior del separador de agua, encontrará una perilla o tornillo. Desenrosque suavemente esta perilla o tornillo en sentido antihorario y el agua fluirá naturalmente. Después de que el agua fluya limpia, apriete la perilla o tornillo en el sentido de las agujas del reloj y el vehículo puede reanudar su uso normal.
Si se detecta que el agua que sale está sucia, se puede inyectar agua limpia en el separador de agua para enjuagarlo y evitar que la pared interior se oxide por la suciedad. Además, el drenaje y el reemplazo regulares del separador de agua son medidas importantes para mantenerlo en buenas condiciones de funcionamiento. Por lo general, se recomienda ajustar el tiempo de reemplazo según el uso real y la calidad del combustible, generalmente después de una cierta cantidad de kilómetros.